针对变种人的清扫行动开始了！
　　在哨兵机器人的镇压下，变种人处境水深火热。
　　惊奇女孩琴・格雷受X教授之托，寻找并解救变种人同伴。暴风女、野兽、钢力士和冰人相继加入阵营，入住泽维尔天赋儿童学院。而这些学生中的佼佼者，组成了X战警！
　　与X教授颇有渊源的万磁王为了迫使总统撤回哨兵机器人法案，率领变种人兄弟会发动了一起绑架行动。X战警能否救回人质、化解僵局？另一方面，变种人的终极噩梦――X武器计划能否被X战警斩草除根？