作者根据自己对大自然物种的观察，结合他人的观点，以及家养物种的变化规律等，对物种的起源、进化、分布等问题进行推论，得出著名的自然选择学说。接着，他又尝试对变异来源进行推论，并结合实验结果等，对那些向他提出质疑的人进行解释与回答。*后，他又从地质学证据入手，尝试揭开物种分布之谜，更进一步地论证了自己的学说。

本套作品从作者本人论述的递进关系入手，将达尔文的《物种起源》分成三本出版，便于小读者们对全书有一个更好的理解与认识。