本书分为四部分内容。第一部分介绍水生态系统和河流生态系统健康的概念与内涵，总结国内外水生态系统和河流生态系统健康评价方法及其研究进展。第二部分以济南市为研究区，构建不同生物指标的水生态系统健康评价指标体系。第三部分以北京市北运河流域为研究区，构建北京市北运河综合健康指数。第四部分以渭河流域为研究区，构建鱼类生物完整性健康评价指数，对渭河流域河流生态系统健康进行评价。