中央档案馆保存有侦讯1109名日本侵华战犯的档案。《中央档案馆藏日本侵华战犯笔供选编》第一辑50册，涉及日本战犯档案超过26000页。该书以影印方式对侵华战犯的自笔供述作了无删节修改的全面呈现。日军侵华战犯在笔供中对所犯罪行供认不讳。南京大屠杀，制造和使用细菌武器，虐杀战俘，强征“慰安妇”，奴役、残杀、掠夺和平人民等违反国际准则和人道主义原则的残虐暴行被彻底揭露，这是日本军国主义侵略者对中国人民所犯滔天罪行的铁证。